無互連線控制方法與有互連線控制方法相比，具有以下優勢：
1)模塊化程度更高。由于無互連線并聯的各模塊問沒有信號線相連，各個模塊間完全獨立，是一種完全冗余的并聯，其模塊化程度更高。
2)可靠性更高。由于模塊問沒有關聯，因此單個模塊的故障不影響系統的工作，大大提高了系統的可靠性。
3)易擴容和維護。模塊問相互獨立，因此系統進行容量擴展相當方便，同時維護某個模塊也極為便利。
4)應用前景更廣泛。有互連線并聯的模塊間的相互連線是一個不穩定因素，因為一旦連線出現故障，系統也會受到影響。另外，相互間的連線會給系統來噪聲，影響供電質量，同時也限制了模塊的空間。所有這些缺點無互連線控制都不存在，因此無互連線控制的應用前景更被看好。

互連線控制方法也有下列一些缺點：
1)控制策略復雜。要達到較高的均流度，經典PQ法還不夠，因此還必須引入一些復雜的控制，如PI、PD等，以及對P、Q等進行低通濾波等。
2)成本較高。目前的無互連線并聯都是在數字控制的基礎上實現的，模擬控制行不通，而有互連線并聯則可以通過模擬控制來實現。并且無互連線控制對數字芯片的運行速率、采樣速率和精度也有較高的要求，一般的數字芯片（如片機）不能勝任，目前主要是用DSP芯片來實現，這使得系統的成本相對較高。